植物细胞组织培养，如食用菌生产、桉树苗接种等操作对生产环境的要求较高，因此在操作和培养过程中，最重要的是防止细菌等的感染，无菌设备非常重要。按照国外的经验，一般植物组培实验室和生产车间应该是在无菌环境下生产，但由于无菌室建造及运行、维护成本较高，目前在国内还不能广泛普及。国内主要目前采用的是局部净化，超净工作台已经成为了，组培超净工作台目前已经广泛应用于植物组培，实验室，食用菌生产等环境。部分食用菌组培采用流水线接种超净台，称之为流水线超净台。

无菌室主要用于植物材料的消毒、接种、培养物的继代转移等。这里是植物组织培养研究中最关键的部分，关系到培养物的污染率．接种工作教率等重要指标要求地面、天花板、四壁尽可能光洁、无尘，易于采取各种清沽和消毒措施。

  接种无菌室一般设内外两间，外间小些为准备室（供操作人员更换工作服、工作帽、拖鞋，洗手及处理外界采样准备，更衣洗手消毒后进入风淋室，把进入车间的人员身的灰尘吹掉，避免员工将毛发等带入车间。然后通过传递窗将无菌培养材料杀菌后送入接种室，以防止带人病菌，保证无菌室能长时间和大量进行无菌操作）。内间稍大，供接种用。

无苗室内应安有紫外线杀菌灯或臭氧发生器，在操作前至少开灯20min。同时室内应定期用甲醛和高锰酸钾蒸气熏蒸(或用70%酒精或0.5%苯酚啧雾降尘和消毒)。无菌操作室需备有固定式载物台、移动式载物台、广口瓶、酒精灯、酒精棉、器械支架、手术剪、解剖刀、解剖针、镊子等用于接种。近年来，多数实验室都采用超净工作台来代替无菌操作室。超净工作台不仅操作方便，而且效果也很好。